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Bioinformática

Infraestrutura para bioinformática e análise genômica

Pipelines de sequenciamento, montagem de novo, anotação e análise comparativa exigem CPU paralelo, storage de alta vazão e memória grande. Estruturamos o ambiente para que o seu laboratório rode análises de horas, não de semanas.

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O que entregamos

Ambientes funcionais para pesquisa — implantação, treinamento, suporte e evolução contínua.

  • Dimensionamento de CPU, memória e I/O para NGS e assembly
  • Arquitetura de storage paralelo para datasets que crescem a cada corrida
  • Integração com filas e ambientes reprodutíveis (conda/containers)
  • Implantação, treinamento da equipe e suporte na operação dos pipelines

Como atuamos nesta aplicação

Versão resumida da jornada — o mesmo método do hub, adaptado ao domínio.

01 Entendimento científico

Projeto, workload e metas da pesquisa.

02 Arquitetura tecnológica

Compute, rede, storage e orquestração.

03 Viabilização técnica

Especificações do ambiente, apoio a fomento (Finep, CNPq) e planejamento de crescimento gradual.

04 Aquisição especializada

Apoio técnico ao mecanismo mais adequado — compra direta, fomento ou importação via fundação.

05 Implantação, treinamento e sustentação

Entrega operacional, integração, capacitação da equipe, suporte e evolução contínua.

Workloads típicos

Exemplos reais que orientam o dimensionamento — não catálogo de produtos.

WGS / WES RNA-Seq De novo assembly Variant calling Metagenômica Anotação funcional

Workflows e ambiente de referência

Como a pesquisa costuma rodar na prática — o hardware serve ao fluxo científico, não o contrário.

Compute paralelo Nós CPU de alta memória para assembly e variantes
Storage paralelo File system de alto throughput para FASTQ e BAM
Orquestração Slurm, Singularity/Apptainer e pipelines reprodutíveis
Rede Baixa latência entre nós de processamento e camada de dados

Quem dimensiona

Arquitetos com experiência em pesquisa e supercomputação — quem desenha o seu ambiente apoia desde a primeira workstation até clusters, com treinamento e sustentação após a entrega. O pesquisador não fica sozinho.

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