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Biologia molecular

Infraestrutura para biologia molecular e proteômica

Simulação molecular, docking, análise estrutural e proteômica em larga escala. Infraestrutura preparada para tempos de simulação longos e datasets que crescem rápido.

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O que entregamos

Ambientes funcionais para pesquisa — implantação, treinamento, suporte e evolução contínua.

  • CPU/GPU balanceados para MD, docking e pipelines omics
  • Storage para trajetórias, estruturas e espectros
  • Ambientes reprodutíveis com containers
  • Apoio a projetos Finep/CNPq, implantação e capacitação da equipe

Como atuamos nesta aplicação

Versão resumida da jornada — o mesmo método do hub, adaptado ao domínio.

01 Entendimento científico

Projeto, workload e metas da pesquisa.

02 Arquitetura tecnológica

Compute, rede, storage e orquestração.

03 Viabilização técnica

Especificações do ambiente, apoio a fomento (Finep, CNPq) e planejamento de crescimento gradual.

04 Aquisição especializada

Apoio técnico ao mecanismo mais adequado — compra direta, fomento ou importação via fundação.

05 Implantação, treinamento e sustentação

Entrega operacional, integração, capacitação da equipe, suporte e evolução contínua.

Workloads típicos

Exemplos reais que orientam o dimensionamento — não catálogo de produtos.

Dinâmica molecular Docking virtual Proteômica / espectrometria Estrutura de proteínas Metabolômica Análise de redes biológicas

Workflows e ambiente de referência

Como a pesquisa costuma rodar na prática — o hardware serve ao fluxo científico, não o contrário.

GPU/CPU Conforme software (GROMACS, AMBER, VASP biológico)
Memória Nós de alta RAM para sistemas grandes
Storage Paralelo para trajetórias e bancos estruturais
Filas Priorização de jobs longos vs curtos

Quem dimensiona

Arquitetos com experiência em pesquisa e supercomputação — quem desenha o seu ambiente apoia desde a primeira workstation até clusters, com treinamento e sustentação após a entrega. O pesquisador não fica sozinho.

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