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Biologia molecular

Infraestrutura para biologia molecular e proteômica

Simulação molecular, docking, análise estrutural e proteômica em larga escala. Infraestrutura preparada para tempos de simulação longos e datasets que crescem rápido.

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Que infraestrutura um laboratório precisa para simulação molecular, docking e proteômica?

Biologia molecular e proteômica combinam jobs longos (MD, docking) com datasets omics em crescimento — exigem balanceamento CPU/GPU, memória ampla e storage paralelo. A LFC Governo estrutura ambientes reprodutíveis com containers, filas e apoio a fomento e capacitação.

  • CPU/GPU dimensionados para GROMACS, AMBER, docking e pipelines omics
  • Nós de alta RAM e storage paralelo para trajetórias e espectros
  • Filas com priorização de jobs longos e ambientes containerizados reprodutíveis

O que entregamos

Ambientes funcionais para pesquisa — implantação, treinamento, suporte e evolução contínua.

  • CPU/GPU balanceados para MD, docking e pipelines omics
  • Storage para trajetórias, estruturas e espectros
  • Ambientes reprodutíveis com containers
  • Apoio a projetos Finep/CNPq, implantação e capacitação da equipe

Como atuamos nesta aplicação

Seguimos a mesma jornada consultiva do hub Pesquisa & HPC — da escuta científica à operação — adaptada ao domínio e ao estágio do seu laboratório.

Entendimento do projeto, arquitetura, viabilização, aquisição especializada e sustentação pós-entrega. O hardware entra quando a arquitetura já faz sentido para o workload.

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Workloads típicos

Exemplos reais que orientam o dimensionamento — não catálogo de produtos.

Dinâmica molecular Docking virtual Proteômica / espectrometria Estrutura de proteínas Metabolômica Análise de redes biológicas

Workflows e ambiente de referência

Como a pesquisa costuma rodar na prática — o hardware serve ao fluxo científico, não o contrário.

GPU/CPU Conforme software (GROMACS, AMBER, VASP biológico)
Memória Nós de alta RAM para sistemas grandes
Storage Paralelo para trajetórias e bancos estruturais
Filas Priorização de jobs longos vs curtos

Quem dimensiona

Arquitetos com experiência em pesquisa e supercomputação — quem desenha o seu ambiente apoia desde a primeira workstation até clusters, com treinamento e sustentação após a entrega. O pesquisador não fica sozinho.

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